2003-09-01から1ヶ月間の記事一覧

すげー!

勤務時間とか給与がちゃんとあるんや! 賞与年2回ってのにもびっくり! 設立は800年以上も前の1199年だそうです! うーん、世の中色んな仕事があるもんなんですなー。

今日は

一日書類書き。気が付けば夜になってましたよ。そうゆうことはあんま回ってこーへんやろうとたかをくくってんけど大甘でした。これから段々そうゆうのが回ってきそうな感じ。早めに何とかせねば。

cygwin

IT

自宅のマシン(WinXP)上でTeXを使えるようにしようと思いcygwin入れました。はるか昔、まだ山奥にいた頃に試したことがあったんですが、その時はXを使えるようにするのに非常に苦労した記憶があります。TeXだけやったらWindows用のやつを入れてもよかったんで…

Jemboss

BI

EMBOSSのGUIであるJembossに関する論文がBioinformaticsに出てました。 Carver T, Bleasby A. The design of Jemboss: a graphical user interface to EMBOSS. Bioinformatics 19(14):1837-1843.

BioGraphicsでGC含量をプロットする方法

表題にあることをやってみたくなったので、試してみました。なお、手元にあるBioPerlのバージョンは1.2.3。古いのやとちゃんと動かへんかも。当然のことながらGDもいります。 で、どうやったかと言うと、 perldoc Bio::Graphics::Panel ってやって出て来るサ…

SQLite

前にちょっと書いたんですが、SQLite試してみました。サクサク動くのでなかなかええ感じです。デーモン立ち上げる必要が無いってのもgoodです。 で、データベースを作って、テーブルを作って、さぁデータを入れようと思ったところで見事にハマりました。今ま…

UniProt

BI

ちょっと前に話題になってたUniProtですが、webサイトが出来てました。まだweb越しにデータを見れるようにはなってへんみたいなんですが、ftpサイトの方にはデータが入ってました。中身を見てへんので詳細は分かりませんが、データはXML形式で配られるようで…

京言葉

前の続き、とゆうわけでは無いんですが、また見つけたのでメモ代わりに。

IT

ラクダ本(最近やと線虫本やおたまじゃくし本かな?)の出版元として有名なoreillyで、カタログのPDFがダウンロードできるようになったらしい。早速ダウンロードして印刷してみる。いやー楽チン。これでもうカタログを送ってもらわんでもええですな。他の出版社…

EMBOSS-GUI

BI

最近業界で話題騒然(?)のEMBOSSをwebから使えるようにしてくれるという素敵なソフトを職場のマシンにいれてみる。そうゆうのがあるってのを前にどっかで見ていずれ試そうと思っててんけど、ちょうど時間が取れたんで。で、インストールは無事終ったっぽい。…

北斗

fun

ボーっとネットを眺めていたら素晴らしいサイトを発見! 早速ブックマークに登録。 リアルタイムで見てただけにひじょーに懐かしい。

BioPerl

BI

の最新版 1.2.3 がリリースされたようです。変更点に関する情報はここにあります。Bio::SearchIOやBio::DB::GFF、Bio::Graphics(HOWTOがアップデートされたみたい)その他に変更・追加があったようです。

Virtual Conference

ってのがあるらしい。BioMOBYに関するトークもあるみたい。とりあえずPowerPointファイルは落とせる模様。その内Videoも見れるようになるんかな。明日チェックしてみよーっと。

Wing

の画像とページへのリンクを貼らせていただきました。まだ研究関連のことはほとんど書いてないのですが、少しづつ増やしていければと思っています。

BLAST

BI

が速くなったそうです。実はごく近場でやってるみたいです。本日からサービス開始なんだそうですが、どこに行けば使えるのかは知りません。

EMBOSS翻訳プロジェクト

BI

4章のドラフトが出来たのでアップロードする。

ちと遅れましたが、 祝!優勝!!!

うーん

どうやら風邪をひいてしまったらしい。鼻がずるずる言ってる。水曜くらいからそんな感じやってんけどいっこうによくならん。むしろ微妙に悪化してる感じ。風邪なんていつ以来なんやろ。一人暮らし初めて8年の間に1回か2回しかひいてへんかってんけどなー。や…

EMBOSS翻訳プロジェクト

BI

のお手伝いをすることに。今週来週と祝日が多いのでそれを利用してやろうかと。使ったことがあるプログラムに関する記述がある&空き具合からここの翻訳をすることに。ドラフトが出来たらプロジェクトのページにアップします(多分今週中)んで、ご覧になられた…

復活

MC

U字ロックが取れへんようになって半年近く眠っていた原付がようやく復活。これで多少は生活圏が広がるかな。そういや前に乗ってたバイク(RF400R)の製造元に関連情報が無かったけどもう生産してへんのかなぁー。どうなんやろ? 金が貯まって生活に余裕が出来…

o'reillyからBLASTって本が出たってのはちょっと前に聞いてたんですが、まさかIN A NUTSHELLシリーズにもバイオインフォマティクス関連の本が出てたとは思いもしませんでした。その名もSequence Analysis in a Nutshell。その名の通り配列解析の際に頻繁に利…

グリッド対応データベース

IT

ってのがあるんや。へぇー。ちなみに某所で行われてる某グリッドと関係あるのかどうかは不明。多分無いでしょう。

A

どうやらgoogle誕生5年のようですね。"Celebrating Google's 5th Birthday"って書いてありました。しかし凄いなー。わずか5年で今や世界No.1検索サイトやからなー。5年前って何使ってたっけなー。gooとかyahooとかかな。

Q

googleのトップの絵が変わってるけど、今日って誰かの誕生日なんかな?

携帯

の機種変更をしてきた。といっても新しく買ったわけじゃなくて親のお古ですが。最新版のを手に入れたので今使ってるやついらんから、ということで3世代ほど前のやつを使っていた私にくれたんです。今度のはカメラがついてるやつなんですが、多分使わんやろう…

Part4

TH

半分終了。

データ

をどのようにして見せるかによって、論文の受理・不受理が決まることがあるらしい。 Graph with Gusto. The Scientist 17(17):56 下の方にある、グラフを作成する際の5つのtipsも参考になるかと。How to Report Statistics in Medicine: Annotated Guideline…

...

すいません。明日のイベント行けなくなってしまいました。昨日の晩メールが来て、明日急拠ミーティングが入ってしまったのです。しかも2つも(昼からと夕方から)。しかし、よりによって何で明日なんやー。

残り7

Part3

TH

流しておいたデータはまだそのまま(まだ流れてる…) とりあえず、依頼された件にとりかかる。 そのうち連絡しまーす。