2003-10-01から1ヶ月間の記事一覧

うわー

何か職場にウイルスメールが蔓延してる。出回ってるのはこいつ。皆様もお気をつけください。 しかし、最近多いなー。

RedHat Linux

IT

が9で終わるらしい。Enterpriseは残るそうやけど。ichan::Weblogさんより。 そういやこないだ職場にある計算用マシンにRedHat9入れたとこやのに… タイミング悪すぎ。もうちょっと前に知ってたらVineでも入れててんけどなー。 うーん、アップデートどうしよう…

Vine2.6r3

IT

現在テスト中だそうです。特に問題が無ければ月末にリリースされるそうです。来週中ってことです。出たらアップデートしよーっと。

3連勝! 日曜で決まりや!

2連勝! この勢いで一気に4連勝や!

小ネタ

金曜のセミナーで最もウケていたもの。タイトルはたしか「ヒトとチンパンジーの差は1%もない」みたいなことやったと思う。ものはこれ。アメリカでもウケてたらしい。

本日メモってきた単語

intein, readthrough

本日メモってきた単語

peptidome, miRNA, siRNA

イベント会場にて

人の多さに驚く。人込が苦手な私にとっては結構大変。分生と同じ位人がいそう。しかしようけいるなー。私は元々情報系だったんですが、こんなようけ人がいる会議は情報系ではまずないんちゃうかな。セッションも15並列くらいでやってるし。最後にいったセミ…

何とか

ひと段落つける。これで今日明日とイベントに行けそう。あとは返事待ち。

マーフィー?

明日からパシフィコであるイベントに行くつもりやったのに、今日コメントが返ってきた。一週間以内に訂正版を出せと言われてしまった。今まで2ヶ月近くも待たせといて何故今頃…。と言ってもどーしよーもないので、今日、明日、明後日でやれるとこまでやって(…

PSB2004

BI

さっき気づいたんですがPSB2004の論文リストが出てました。

cygwin (X上での日本語キーボードの設定)

以前、インストール&設定したcygwinですが、私の手元のマシンでは、Xを立ち上げたときにキーボードのキーアサインが英語(多分101)のものになってしまうという問題がありました。要はキーボードの上に書いてる文字とそれを打ったときに出てくる文字が違うこと…

shfs

IT

試してみました。こいつはsshでつなぐことのできるマシン間でディレクトリを共有したい!ってな時に使えるソフトです。で、なかなかいい感じです。ネットワーク越しにマウントするので間にあるネットワークの速度に応じてレスポンスの速さも変わるみたいです…

ssh経由でcvs(sshはデフォルトじゃないポートでつなぐ)

必要に迫られて表題にあることを試みる。 やりたいのは「手元のマシンmy.localhost.orgからssh経由でリモートmy.server.jpにあるcvsリソースにアクセスして色々やりたい」ってこと。 で、以下はやったこと。 my.localhost.orgの$HOME/.ssh/configに以下のよ…

Ensembl

BI

さっき気づいたんですがEnsemblのトップページを見るとHuman v.17.33.1って書いてます。で、ftpサイトの方を見ると、human-17.34ってディレクトリが出来てます。更に潜っていってみるとdataの下にgolden_pathだけあります。何でやろう? golden_path以下だけ…

HPRD

BI

というデータベースができたらしい。Human Protein Reference Database、略してHPRDだそうだ。論文はここ。パッと見た感じ、こないだ言ってたUniProtと直接関係がある、ってわけではなさげ。

VineLinux 2.6r3 beta1 for intel

IT

のテスト中だそうです。変更点は 2.6 errata の適用 (kernel-2.4.22-0vl2.3など) インストーラのバグフィックス インストールクラスの変更 (最小、フル、ワークステーション、サーバ、カスタム) だそうです。近々出るんかな。3が出たらまたアップデートしよ…

GIW2003

BI

のaccepted paperのリストが出てました。そういや今年はパシフィコでやるんでしたな。日数も4日に増えてましたな。

SOURCE

BI

ってデータベースがあるらしい。どんなのかというと SOURCE is a unification tool which dynamically collects and compiles data from many scientific databases, and thereby attempts to encapsulate the genetics and molecular biology of genes from…

メモ(2)

思い出した! これや! Lord PW et al. Semantic Similarity Measures as Tools for Exploring the Gene Ontology. Proc. PSB 8:601-612, 2002. っておんなじ人が書いてるやん。そりゃ似てるわけやわ。

メモ

ちょっと気になったんで忘れる前にメモ。月曜にでもダウンロードしてみるかな。 Lord PW at al. Investigating semantic similarity measures across the Gene Ontology: the relationship between sequence and annotation. Bioinformatics 19(10):1275-128…

slcview

BI

Linuxのコマンドラインで使える、マイクロアレイデータ等のクラスタリング結果をこんな感じの画像にしてくれるslcviewの新しいやつが出てました。2.0になってました。お手軽に使えるってのと読みやすいソースコードがついているので結構よさ気です。大量に処…

GO(続き)

GOが取れたのに合わせて大元のページが新しくなった模様。

PathBLAST

BI

なるソフトがあるそうです。元ネタは Kelly BP et al. Conserved pathways within bacteria and yeast as revealed by global protein network alignment. PNAS 100(20):11394-11399, 2003. うーん、いろんなBLASTがあるんですなー。ExpressionBLASTみたいな…

GO

が無くなりました。mailとwebのアドレスから。今まで通りGO付きの方も使えるみたい。GO無しでもOK(確認済)。付いてる方がいつから使えんようになるかは不明。