BioPerl
の最新版1.4がリリースされたようです。時期的にはちょうどクリスマスプレゼントってことなんかな。トップページにあるのはまだ1.2.3ですが、ここにはもう最新版のファイルがあります。リリースノートはここ。その中からいくつか目にとまったものを。
- "Over 3000 file changes have gone into this release since the 1.2 development tree was branched off from the main." だそうです。すげーなー。
- 最近話題のsiRNA関連のモジュールが出来た模様。
- Bio::Tools::SiRNA, Bio::SeqFeature::SiRNA - small inhibitory RNA
- blatのパーサも追加されたようです。
- new parsers in Bio::Tools: Blat, Geneid, Lagan, Mdust, Promoterwise, PrositeScan
- Bio::SeqIO でタブ区切りとかKEGGのファイルも読めるんや。へぇー。
- new Bio::SeqIO formats: tab, kegg, tigr, game; important fixes for old modulues
- いくつかのHOWTOが追加された模様。Feature AnnotationとFLAT Databasesは要チェックや！
